备战和支援方面的顾虑
讽刺的是，随着首次实战的新闻被放出，F-35联合项目办公室却在遭受来自各方面的压力，以改善飞机的战备和妥善率。2018年美国国防部长詹姆斯.马蒂斯要求美军的F-35、F-22、F-16和F/A-18E/F达到80%的任务出勤率(MCR)，尽管F-16和F/A-18E/F机群都得到了显著提升，但F-22和F-35机群仍然没有多大改观。美国代理国防部长帕特里克.尚恩(Patrick Shannhan)4月在众议院拨款国防小组委员会听证会上发表讲话时指出，F-22和F-35机群的备件供应不足，而且低可探测涂层等地方急需维护。此外，F-35的后勤网络在全球管理和调派关键零配件时出现了困难，积压的零配件总数有4300件之多。
2020年6月，388FW联队的艾米莉.汤普森(Emily ‘Banzai’ Thompson)上尉成为了首位参与实战的F-35女性飞行员。
2019年8月13日，58FS中队的F-35A 12-5053降落在威斯康星州的沃尔克机场，参与北方闪电演习，此机于2020年5月19日坠毁。
当马蒂斯签发这道国防部命令时，F-35的任务出勤率只有55%。根据由政府问责办公室进行的国会授权的F-35年度报告内容，2018年5月至11月间，全世界只有27%的F-35完全具备作战能力。很多美国空军的内部人士也承认了F-35糟糕的战备状态，经常会一点点小问题而影响妥善率和出勤率。然而，该项目在全球支援方面仍旧面临巨大的障碍，有人呼吁改善关键部件的可靠性，并通过加强计划和备件分配，使供应链与最终使用者的需求相匹配。
通常，零配件是通过长期订单而购得的，以此减少开销，然而，F-35项目目前的状态意味着飞机服役后，这些零配件数量往往于飞机的标准不符。政府问责办公室的报告说，在陆战队最近展开的部署中，44%的零配件都无法匹配相应的飞机。国防部也在为F-35的后勤足迹有限的理解和管理而挣扎，据报道，它正在努力跟踪其库存零件。
飞行员对光电瞄准系统进行飞行前的检查。这种瞄准系统类似于传统美国空军飞机在吊舱系统中使用的AN/AXQ-33狙击手吊舱，但F-35将其装入了机身内部。
在顾虑后勤方面的同时，国防部也在考虑降低F-35项目的成本和未来部署。联合项目办公室主任马特.温特将军说，2018年，F-35A每个飞行小时的花费是44000美元，并决心在2024年将其缩减至34000美元，2025年减少至25000美元。但他同时也指出，后者很难达成。前一个目标花费了5年时间，而且仅给下一个目标留了1年，这是不太现实的。同时，F-35这次阿联酋的部署只透露了少量信息，长时间的部署的后勤支援足迹和任务出勤率将给美国空军和国防部提供关于项目成熟度和未来需求有价值的指导。
在亚利桑那州异常阴暗的天空下，56OG大队指挥官马特.伦巴格(Matt Renbarger)上校在一次低角度扫射中用F-35A的25mm GAU-22航炮开火。
核打击能力
2020年6月22日，美国政府国防可视信息发布服务(DVIDS)网站上公布了一系列F-35联合项目办公室展示F-35A投放B61-12核弹教练弹的测试照片。尽管众所周知，F-35A计划中是一款双功能飞机(DCA，意味着它将能够同时投放常规武器和核武器)，但这标志着首次公开B61-12核弹试验的照片。文字说明透露了先前未知的测试细节，这些测试是由加州爱德华兹空军基地412TEW联队416TES中队的F-35A试飞，并于2019年开始。第一次安全分离于2019年6月27日进行，使用研发型F-35A AF-01号机。第六次分离试验于2019年11月7日进行，再次使用AF-01号机。2019年11月25日，首次使用AF-06/07-0744号机。由AF-01号机执行的第六次分离试验于2020年2月6日进行。图片中显示的最近一次试验是4月2日由AF-06号机完成的。F-35A DCA的核认证计划于2023年1月进行。投放核武器的能力将包含在Block 4版本软件中，使其具备B61-12的初始核打击能力。
2019年6月27日，美国空军416TES中队的F-35A 07-0744 (AF-06/ED/416 FLTS)在加利福尼亚州爱德华兹空军基地上空进行双重能力试飞期间首次投放B61-12核弹教练弹。
