侧风试验很有趣场景，这里有两种方法来实现所需目标。飞行员可以在悬停状态下从逆风方向转90°，从自然风中产生侧风，然后在地面上侧向移动，以达到所需的测试条件。风可以受迫从任何角度吹向飞机。另一种方法是在自然获得所需风速时进行测试，用脚蹬转动着飞机，直到达到测试点要求的方向。威尔逊说：“DT II阶段是关于侧风包线扩张，迎风风速达到40海里/小时，以及首次起飞和着陆时内部挂载教练弹。”
内部弹舱的挂载了武器后会使飞机重心向前移动，导致它的行为稍有不同。测试它是DT II阶段的目标。威尔逊解释说：“我们还必须定期投放武器，以满足必要的着陆重量。DT II阶段是F-35第一次抛弃武器。我们还想在夜间飞行，利用舰船运动进行着陆，以扩展载荷包线，评估运动对控制系统的影响，以及飞行员如何跟踪运动，并进一步强化抗热飞行甲板涂层。”美国海军陆战队试飞员吉米.克里夫特少校于8月14日首次夜间垂直着陆。VX-23中队还对DT I阶段失败的测试点进行了再测试。DT I期间的起飞显示，尾喷管在某些角度摆动，离飞行甲板只有2英寸，需要改进飞行控制系统。威尔逊说：“你不能在岸上这样测试，所以我们重复了DT I阶段的一些情况，以证明所做的修正与模拟相符。”。
2013年8月16日，VX-23中队的F-35B BF-05在黄蜂号的甲板上进行垂直悬停。
夜间作业、头盔显示器、任务系统和侧风
金根少校和斯科菲尔德少校于第二天获得了舰上起降资格，之后飞行测试团队准备进行夜间作业。“当我完成第一次夜间任务回到待命室时，我脸上露出可笑的笑容，我从来没有在执行夜间海上任务之前感到压力，”威尔逊说：“在夜间驾驶鹞式就是这样，你真的觉得自己逃脱了惩罚。因为你受过很高的训练，所以你可能会很好，但你总是知道不会出什么问题，你会搞砸的。在F-35上，体验是如此的不同，因为它为你保持高度，它照顾你，你实际上可以不去管它，这通常是你能做的最好的事情。它能保持着漂亮的悬停，比你用手做的要好得多。这确实是一项任务，只需要需要监视系统。在大约两个小时内完成了三次垂直降落，加燃料，再次起飞和返回，与鹞式相比简直是小菜一碟。”
这个测试试图证明飞行员可以通过使用肉眼和第二代头盔显示器来改善相对于鹞式的夜间降落任务。威尔逊说：“这是我们做得最好的。他证实，在短距起飞/垂直降落操作中不会遇到第二代头盔显示器的功能问题。你在海上看到的效果不一定能在岸上看到。例如，地平线上的太阳会从水面反射回来，并有可能盖掉一些头盔显示器的符号。这不太好，但没关系。头盔的主要问题发生在飞机开始抖振时。使用短距起飞/垂直降落模式时，我们不会受到太多的缓冲，而且大多数时间都是一次舒适的旅程。”测试活动也在飞机飞行时进行，正如威尔逊所解释的：“我们进行了任务系统测试，以确保与飞机与舰船的作战互通性：通信、导航、战术导航和敌我识别系统。我们还可以与白天和夜间的可视条件下使用新的仪器来模拟恶劣天气中返回母舰的能力。”
2013年8月26日，F-35B BF-01在黄蜂号上的夜间降落。
DT II阶段中测试短距起飞/垂直降落作业的另一个方面就是确定了风对舰岛的影响。当飞机在盘旋时，舰岛位于右边。如果风从右边吹来，它就会绕着舰岛转，从不同的角度抓住飞机。“那会让从烟囱里冒出来的热气向你袭来，这是个坏消息。飞机不喜欢吸入热气：这会降低性能。我们的结果好坏参半，有些好，有些不好。如果风从岛后吹来，飞机开始感觉像是在颠簸。来自飞机前部周围的热气削弱了我们的性能裕度，但没有达到我们担心的程度，因为飞机有能力承受这些影响。我们从右边增加了10节的侧风，从左边增加了15节的侧风，形成了一个超级包线。这是一个巨大的成功。”
作战测试与评估总监2013财年报告将对DT II阶段黄蜂号进行的永久性修改列为：在F-35B使用的两个着舰点的飞行甲板下侧增加横向加强筋，并在一个着舰位置的飞行甲板上部使用热防滑材料。之前派遣到黄蜂号上的时候，海军海上系统司令部在另一个着舰点使用了防滑材料。甲板边缘改造，包括通信系统的拆除、更换、重新定位和屏蔽。为锂离子电池充电和储存区域增加了火灾探测和报警系统。这次派遣的黄蜂号临时改动包括：锂离子电池充电和储存区。NAVSEA尚未确定这些区域的最终设计。短距离起飞加速线灯光。分析结果将确定这些灯的精确位置，并增加试验设备。
2013年8月15日，F-35B BF-01在黄蜂号上进行第二次夜间起降测试。
DT II阶段的反馈
DT II阶段的结果摘要也发表在2013财年的作战测试与评估总监报告中：“部署满足了收集数据的主要目标，以便开发用于起飞和着舰的Block 2B版本作战飞行包线，来支持舰队放行和海军陆战队初始作战能力的形成。与2011年首次部署相比，测试团队扩大了飞机重量和重心范围，飞行活动包括夜间行动和内部弹舱教练弹的挂载。美国海军正在开发解决方案，以克服将F-35B整合到两栖攻击舰上的诸多挑战：在F-35B着陆点的飞行甲板上大规模使用热防滑材料。
修改飞行甲板结构以消除多余应力，包括安装在现有飞行甲板结构下侧的横向面板断路器。为JSF所需的锂离子电池设计单独的充电和储存柜，以及飞行员飞行设备的新储物柜，因为JSF头盔比传统头盔更大、更脆弱。制定新的灭火程序，以防在携带内部弹药的飞机附近的甲板发生火灾。了解航炮吊舱的储存要求，对正在进行的F-35B发动机更换进行可行性研究，包括为船上发动机储存分配更大的空间，通过目前安装在一艘补给船上的海军系统进行补给，而且福特级航母就计划如此配备。
2011年10月11日，VX-23中队的F-35B BF-02离开黄蜂号，返回帕塔克森特河基地。
海军已确定，由于发动机的噪音太大，甲板上的人员需要新的主动降噪个人听力保护装具。甲板下方的人员也可能需要噪声阻尼材料和/或个人听力保护装置。在为期18天的海试中，这两架飞机于10天的测试中完成了95次起飞和垂直降落，并进行了17次夜间起飞和降落。“那是一个极其成功的海上时期。我们敲定了包线范围，而且都是可以用于舰队部署的。事实上，除了海拔较高的海况，我们全都确定了。”金根少校说。