雷电-80工程
和闪电工程平行展开的----就是后来的SR.II项目----让顶点设施找到伊朗最好的2名航空工程师来展开另一项和F-5相关的工程，目的是为了改善飞机的空气动力外形。结果就是这种型号的魔改----雷电80，给一架F-5E安装2个垂尾。
必要的研发工作于90年代中在伊朗空军的萨塔里航空大学开始，但是因为管理不当及缺少最基本的设备而进展缓慢，比如风洞。雷电80的团队工作得到了国防工业部和各个私人承包商以及伊朗空军的支持，并提供了一架F-5E用于原型机改造。
结果就是用一个方形进气道替代了原先的弧形进气道，新的整流罩前方安装了一根空速管，没有翼尖导弹发射导轨，只有一门M39航炮，还安装了敌我识别器和战术导航装置，所有这些都是为了减轻飞机的重量。经过了18个月的工作后，原型机----S.110-001号机----已经准备好用于地面测试，全身被涂成浅蓝色，机鼻绘有伊朗国旗。进行了10次地面测试后，这架飞机于2004年2月7日完成首飞，通常都由3-7302号机伴飞。
飞行测试显示重新设计的机鼻和进气道影响了飞机的机动性，然而，伊朗空军要求顶点设施准备好生产第2架和第3架雷电，并把3-7302和3-7060号机提供给他们。这一次，工程师们没有对空气动力表面的任何东西进行修改，只是把单垂尾改成了双垂尾。接着，S.110-002和S.110-003号机在2007年6月完成了首飞，数周后参加公众展示。同时，顶点设施开始改造另一架飞机，前越南空军的F-5E 73-00873。然而，在2006年8月，伊朗的最高宗教领导层做出决定，把整个项目----包括参与其中的绝大多数工程师----从顶点设施转移到伊朗飞机工业公司。
这张照片拍摄于3-7015号机在TFB8基地的首飞之后，注意重新被打造的前部机身，涂有黄色的防锈漆，后机身仍旧保留着小亚细亚三色迷彩，①代表TFB1基地，因为当时这架飞机服役于11TRS中队，风挡和座舱盖是从越南仓库里弄来的，而且保留着原始的东南亚迷彩。
此后，关于这个工程的不正确报道便相继传出，通常包括了明显的照片PS。这些看起来像是故意误导西方的情报人员，而且错误的信息引发了大量争议，让伊朗蒙羞。
伊朗飞机工业公司在2007至08年间又改造了一架闪电，这时，整个机群的编号从3-7366至3-7369，一共4架。2009至2010年间又改出了2架，但是由于J-85GE-21发动机的问题，3-7371号机的交付被延迟了。更重要的是，自2003年签署合同把闪电升级至雷电II标准以来，伊朗飞机工业公司只是在生产双垂尾的F-5E，飞机上的航电设备没有更换。结果就是伊朗空军拒绝再交付任何F-5E给伊朗飞机工业公司去改造，而且第7架飞机(3-7372号机)的改造仍旧没有完成。
2-7250号机是伊朗空军最老的一架F-5，1992年被修好后仅使用了4个月就被停飞，用于提供零配件，飞行时间也只有50小时。梅赫拉巴德的大修中心在2008年修好了这架飞机，2011年10月8日完成首飞，目前是43CCTS中队里状态最好的一架F-5A。
双座雷电
由于没有可用的双座雷电，飞行员的训练代价是昂贵而又困难的。2009年组建了一支雷电中队后，伊朗空军司令部也意识到雷电教练型的必要性，雷电80的飞行性能和F-5E差不多，但是诸如飞机控制面轴心周围的有效性让任何F-5飞行员转去驾驶雷电时都需要接受换装训练。
2009年末，顶点设施开始了雷电90工程，后来成为了雷电II，目的是为了给F-5F装上双垂尾。