确实，TFB4和TFB7基地的F-5在1989年1月参与了打击毒品运输的任务，有1架F-5F、4架F-5E、2架F-5A和2架F-5B被部署到扎黑丹。为了熟悉地形并让飞行员找到适合的目标，他们进行了数次目视侦察飞行，接着于9日和10日开始执行攻击任务。然而，当地政府向他们抱怨这样的飞行会吓到居民，之后，伊朗飞行员就被禁止使用任何武器。在最后的一次任务里，F-5飞行员帕维兹.纳斯里(Parviz Narsi)和德拉尼.莫伽达姆(Tehrani Moghaddam) 驾驶的F-5F以及巴赫曼.阿克巴里(Bahman Akbari)驾驶的F-5E(可能是72TFS中队的3-7144号机)在扎赫丹以东执行目视侦察任务，却发生了一场不必要的、可怕的事故。2架飞机都在低空高速飞行，然后飞行员开始竞速，那架F-5E擦到了地面，使得尘土被吸进发动机里，导致发动机失效。阿克巴里试图到库尔巴德公路上迫降，但险些和一辆汽车撞上。他跳伞了，弄伤了脊椎骨，而飞机的机鼻和前起落架部分受损严重，在重新回到现役前需要大修。
1993年，F-5E 3-7059和F-5F 3-7159在迪兹富勒的阿巴丹高地上空飞行，为了摆拍，2架飞机都挂载了AIM-9J导弹。
阿什拉夫营地的攻击
虽然在梅尔萨德行动期间被重创，但哈尔克圣战士再度在伊拉克重组，并继续得到来自伊拉克政府的支持。1991年3月，美国领导下的联军打败伊拉克并解放科威特后，伊拉克北部的库尔德人发动了起义。巴格达政府派出了哈尔克圣战士来解决这个问题，结果，恐怖分子对伊朗展开了一场新的攻势，并于1991年4月1日暂时占领了科尔曼沙省内的莫瓦里德高地，期间杀害了大量伊朗的库尔德平民。
4月5日早上，伊朗空军做出回应，从TFB3基地派出了9架F-4E去轰炸阿什拉夫营地，这里是哈尔克圣战士的主要营地，位于伊拉克境内80千米、哈利斯(Khalis)以北28千米处，5分钟后，TFB4基地放出了9架F-5E。F-4E 3-6688的机组没有做出正确的拉起机动，迫使他们弹射跳伞----两人被哈尔克圣战士俘虏后交给了伊拉克人。
接下来的几年，土耳其人开始大力围剿库尔德工人党，后者得到了伊拉克人的支持。土耳其空军对伊朗边境处展开了数次空袭，而且土耳其空军的F-4E数次入侵伊朗领空，但很快就离开了，伊朗空军也没有拦截的意图----TFB2基地的F-5E追不上速度更快的土耳其鬼怪II，而且后者通常都有F-16C在保护。相应地，伊朗空军决定向TFB2基地增派刚从苏联获得的米格-29。这次临时部署变成了永久性驻扎，最终决定把22TFS中队的所有F-5E都交给21TFS中队，而让前者换装米格-29。
到了1994年，哈尔克圣战士经常在伊朗发动自杀袭击，给伊朗平民和官兵都造成了很大伤亡。于是，伊朗空军决定对阿什拉夫营地展开另一次空袭。这次不为人知的任务在1994年11月9日发起，由TFB2基地的1架F-5F和3架F-5E执行。它们扔下了16枚Mk82蛇眼炸弹，自身没有遭受损伤。这次任务是成功的，但它们闯入了美英联军在伊拉克上空设立的禁飞区，导致美国空军从土耳其紧急召起了20架F-15和F-16。TFB2基地在1995年夏还曾受命再度空袭阿什拉夫营地，但由于坏天气而被取消。
和阿富汗的对抗
1990年代，除了轰炸哈尔克圣战士的那些恐怖分子以外，TFB2基地的F-5还被经常部署到伊朗东北部的马什哈德(Mashhad)机场，结果他们差一点卷入了另一场全面战争。