在经历了几年出人意料的激烈战斗和大约15000人阵亡后，苏联开始计划从阿富汗撤军，从1988年开始，到1989年2月结束。1987年9月，阿富汗总统卡迈勒被穆罕默德.纳吉布拉(Mohammad Najibullah)取代。纳吉布拉是人民民主联盟帕查姆派的成员，曾担任阿富汗克格勃特勤局(KHAD)的头目。由于冲突的纯军事途径解决似乎越来越不可能，阿富汗政府开始推行民族和解政策，在纳吉布拉的领导下，这一政策全面展开，可是这一政策的最终目标----结束战争，建立多党政府----从未实现。
纳吉布拉总统成功地继续掌权，直到1992年4月，由于圣战者的压力、北部省份亲政权民兵的叛乱以及苏联停止援助，阿富汗国家机构和军队完全解体。在接下来的几年里，阿富汗内战各方----每一方都有一个或多个外国支持者，他们对战争的持续负有直接责任----试图建立一个统一的政府，相互争斗，结成联盟并打破它们，进行和谈，再次争吵。阿富汗实际上被分成了许多由政党领导人或各种军阀统治的封地。只有塔利班成功地统一了他们统治下的大部分地区，但就连这场激进运动也直到2021年夏才完全征服整个国家，他们主要面对着著名指挥官艾哈迈德.沙阿.马苏德(Ahmad Shah Massoud)以及其他不愿在塔利班压力下放弃抵抗的军事领导人。
阿富汗国内外的许多政客和其他人士最初认为塔利班是这个饱受战争蹂躏的国家的可能解决方案。事实上，在成立后的最初几年里，激进运动可能被视为几乎被遗忘的阿富汗内战的另一个派系----但它更强大，更有能力统一这个国家，并带来和平。然而，到了1990年代末，塔利班领导层与奥萨马.本.拉登及其基地组织建立了非常密切的关系。在1996年被苏丹驱逐出境后，该组织在阿富汗找到了一个急需的避难所。
此前，塔利班领导层并不想成为全球圣战的一部分。1998年8月，当美国驻内罗毕和达累斯萨拉姆大使馆成为自杀式炸弹袭击者的目标时，美国以战斧巡航导弹袭击阿富汗圣战者训练营作为报复。本.拉登支持的恐怖袭击导致塔利班运动在国际舞台上被孤立，并粉碎了塔利班与美国之间任何合作的可能性。2001年9月11日的恐怖袭击事件导致以美国为首的联军入侵阿富汗，并与当地反塔利班政党合作，迅速击败了这个激进运动的常规部队，结束了塔利班对该国的统治，阿富汗的危机在这场凶残的恐怖主义行动后达到高潮。
在结束这段对阿富汗历史的短暂且毫无疑问的肤浅之旅时，我们必须提到影响该国军事和政治发展的一些决定性因素。在整个历史长河中，阿富汗领土一直很难被征服和治理----这是一个痛苦的事实，苏联花了多年时间才意识到，美国及其盟友也在最近几年才意识到这一点。同样的原则也适用于阿富汗的内部政治：尽管有人试图建立一个中央集权的国家，有些人声称取得了成功，但阿富汗的特点始终是中央政府相对薄弱，地方派系相对强大，很难用武力制服。
这种情况源于多种因素，如使许多地区无法进入和难以征服的严酷山区地形、当地人民的独立性以及不喜欢中央干预其事务的地方领导人。此外，阿富汗人由几个具有不同传统和语言的民族组成，然而，全国人民都受伊斯兰教的约束。从1970年代末的反共起义、1980年代以反共圣战的形式延续的起义，以及在1990年代中央政府彻底垮台后，阿富汗最终分裂成许多事实上的独立领土，都是同样的、具有数百年历史的原则的又一体现。
少数民族
阿富汗人口包括普什图人、塔吉克人、哈扎拉人、乌兹别克人、土库曼人、俾路支人、帕夏人和其它几个群体。尽管在某些历史时期和某些地方，这些群体设法和平共处，但他们的历史也以暴力和不平等为特点，并一直持续到今天。
阿富汗所有民族中人口最多的是普什图人，他们主要居住在南部和东部省份，当埃米尔阿卜杜勒.拉赫曼.汗于1893年签署《杜兰线条约》时，他们的领土被人为地划分为阿富汗和英属印度。普什图人约占阿富汗人口的40%，自1747年杜拉尼帝国建立以来，普什图人一直是阿富汗的传统统治者，其它民族试图在国家事务中发挥决定性作用的任何企图都遭到了普什图人的打压。
生活在阿富汗的第二大群体是塔吉克人，这是一个说波斯语的民族，主要居住在东北部和北部地区，包括喀布尔和马扎里沙里夫，以及西部城市赫拉特和其他地区周围。塔吉克人也是塔吉克斯坦东北部与阿富汗接壤的主要民族。在阿富汗最近的政治和对军队的控制背景下，塔吉克人一直是普什图人的挑战者。
阿富汗第三大民族是哈扎拉人，主要是说波斯语的蒙古入侵者后裔，几个世纪以来，他们一直生活在阿富汗中部省份的一个地区，该地区被称为哈扎拉贾特或哈扎里斯坦。大量的哈扎拉人也生活在喀布尔、赫拉特和马扎里沙里夫。与其他信奉逊尼派伊斯兰教的阿富汗民族不同，哈扎拉人的大多数是什叶派。
阿富汗的第四大民族是居住在阿富汗北部平原上的乌兹别克人。乌兹别克人跟随中亚的突厥入侵者的浪潮来到这片领土，并与当地的伊朗部落混杂在一起。哈扎拉人和乌兹别克人经常被执政的普什图人边缘化和压迫，而矛盾的是，只有1990年代的内战才给乌兹别克人和哈扎拉人在国家事务中带来了他们过去从未享受过的权力和影响力。
虽然1980年代的反共圣战见证了普什图圣战者与普什图主导的共产主义政府的斗争，但喀布尔共产主义政权苟延残喘的最后几个月以及随后的几轮内战中，民族被视为建立联盟的重要因素之一。最终，当普什图族塔利班成为阿富汗冲突中的主导力量后，虽然在该领域遭遇了许多挫折，但唯一愿意继续战斗的反对派武装几乎是清一色的非普什图族。