多才多艺的"幽灵"
美国号上的战斗机和之前的所有中队一样，在随TF77特混舰队的巡航期间要去执行屏障战斗空中巡逻、空战战斗空中巡逻、目标战斗空中巡逻、照相护航、攻击、武装侦察任务，绝大多数机组把他门执行对空任务和对地任务的时间平等地划分开。在战斗空中巡逻和护航任务里，F-4挂载了2枚AIM-9D或AIM-9G，还有3枚AIM-7E或AIM-7E-2。在攻击任务里通常挂载6枚Mk82或4枚Mk83，偶尔也用阻尼火箭弹或集束炸弹。所有夜间任务都携带了照明弹。一般，2架执行夜间任务的F-4J都会配上一架A-6A"寻路"机，用自身的数字综合攻击与导航(DIANE)雷达系统为鬼怪II定位目标。执行这些任务时不会开着航行灯，为了避面与同一地区执行任务的其它F-4双机编队相撞，他们要相互错开抵达目标上空的时间，而且尽可能地事先告知目标的位置。这样的预防措施是有原因的，1968年4月15日，2架VF-114中队的F-4B于空中相撞，但所有机组均跳伞获救。
完成了1968年的巡航后经澳大利亚回到米拉马，VF-102中队的F-4J 153886 "Milkvine 112"正在中午的太阳下暴晒。虽然一架鬼怪II的座舱视野范围有限，但已经要比米格-17和米格-21好很多了。由于厚重的挡风玻璃和巨大的瞄准具，米格机的前方视野极为有限。米格-21能够像F-4一样爬升，中空机动性和F-8一样好，可是它在15000英尺高度上的最佳速度为600节左右(空战经常发生的高度)。2种米格机的稳定性和跨音速时的缓冲都有问题，米格-17在低空和高速飞行时操纵很困难，它们的加速性都比不上F-4。米格机较小的体积很难被肉眼发现，而发动机拉烟的F-4却恰好相反。
对地攻击的高度在3500英尺以上，以躲避地面炮火，使得VF-102中队于1968年的对地攻击任务中只损失了2架飞机----其中1架被地空导弹击落。在进入战斗后的第一个月里，"菱纹背响尾蛇"中队总共消耗了超过586000磅炸弹，在这次部署的后期阶段，飞机以56000磅的最大弹射重量起飞，挂载了2枚AIM-9G、2枚AIM-7E、4个LAU-10/A阻尼火箭巢、6枚Mk82炸弹和满油的中线副油箱。轮战期间，VF-102和VF-33中队在菲律宾沿岸练习AIM-7导弹的射击，强化他们的空对空战术，提高导弹的可靠性。随着巡航的继续，飞机的可靠性也在提升，VF-102中队的F-4J "Milkvine 105"连续完成了59次飞行都没有出现任何维护问题。
在F-4J的研制过程中，安装一门航炮是不可能的，尽管美国空军给F-4E装上了一门，可是机鼻过重的F-4J已经在着舰过程中出现了重心前移的问题，因此一切前置的武器全部被取消。自1965年4月9日首次遭遇米格机起，机组们一次又一次地在近距离格斗中错过机会，很多总结报告都说"如果给我一门航炮"。VF-102中队于1968年5月24日抵达扬基站时，他们测试了休斯的Mk4高性能外置航炮吊舱，根据中队的记载，这门炮(Mk11 Mod5型20 mm转膛炮，携弹750发，射速和美国空军的M61A1火神炮差不多)"被证明是非常可靠的，而且精度很高。"
虽然这种吊舱从理论上回应了F-4机组的要求，但并没有配备航母上的鬼怪II，然而，陆战队的F-4中队却频繁使用这种吊舱，尽管在打出几枚炮弹后有卡膛的倾向，可它在近距离空中支援任务里非常有效。在海军的F-4上，这个位置被机身中线副油箱占据着，而且由于弹射时的冲击，航炮吊舱的精度会受到很大影响。
尽管结构密集而又复杂，可是F-4能够在作战任务里承受重击。这里，甲板地勤正在检查被高射炮击伤左主翼的VF-21中队的F-4B-20-MC 151500，此机于1965年被指派给杰瑞.马歇尔(Jerry T Marshall)中尉和哈里.斯皮里奥提斯(Harry C Spiliotis)上尉。第二年，此机作为VF-161中队的"Rock River 216"打下了一架米格-17，当时的机组是比尔.麦圭根上尉和鲍勃.弗劳尔上尉。这架鬼怪II在1968年5月23日前往老挝执行夜间TPQ-10雷达轰炸任务时被高射炮击落，当时服役于VMFA-115中队。
阿喀琉斯的脚后跟
尽管F-4设计师在为美国海军打造一款适合远程截击任务的飞机时，战伤并没有被当成重要的因素被考虑进去，但这种飞机在不可预见的越战环境下非常有弹性。F-4B经常能在平尾被高射炮弹打掉，或者机身结构被高射炮或地空导弹打坏后返回航母。威尔.哈夫上校回忆道在一次RA-5C的护航任务里，一枚炮弹击中了他座机进气道和座舱盖之间的位置，"我认为那不是VT(变时)引信的炮弹，或者只是普通的钢弹打穿了飞机，F-4在中弹后依然能够返回航母。"
然而，飞机上的3个液压系统却相当脆弱，即便是被小口径武器击中，液压就会迅速下降，导致飞机失去控制。液压损伤是战时F-4损失的最主要的原因，只要2个主系统(PC-1和PC-2)失压，平尾就会移动至最大的"爬升"角度，导致鬼怪II做出大过载筋斗，最后失速，将操纵杆置于自然的位置上来锁住平尾，就可以避免这样的事情发生。F-4的内部结构非常密集，因此没有办法去保护这些液压管线，也无法向F-105一样去安装一套备用系统。当其它的控制受损时，一些飞行员可以通过控制油门和尾舵飞往安全跳伞区。
1967年12月16日，在一次攻击建安附近的公路渡口时，VF-21中队的杜克.埃尔南德斯(Duke Hernandez)少校和S.L.范霍恩中尉在压制高射炮火时中弹，2人均在海上安全跳伞，并被海军的搜救直升机接走。1968年4月28日，在攻击边水(Ben Thuy)的北越军仓库时，埃尔南德斯再度跳伞，他的F-4B 153014被高射炮击中后发动机起火，他和雷达拦截官大卫.洛尔切尔(David Lortscher)中尉被一架海军搜救直升机救起。后者一共从鬼怪II上跳了4次伞，但只有这一次是敌军造成的。
在1965至68年随企业号的西太平洋巡航中，VF-96中队采用了6XX的战术编号，而VF-92中队则采用了2XX的战术编号。挂载蛇眼炸弹的"Showtime 603"(之前巴特森和多雷穆斯击落米格-21时的座机)于1967年2月12日在东京湾上空进行空战机动训练时坠毁，机组马蒂.萨利文(Marty Sullivan)少校和保罗.卡尔森(Paul V Carlson)中尉都没能活下来。这里，它和"Showtime 602"一样安装了AN/APR-24电子对抗天线，BuNo 150413号机于1967年2月20日在清化附近被高射炮击落，雷达拦截官伽瑞.桑顿(Gary Thornton)少尉从250英尺高度跳伞，之后在监狱里被关了6年。美国空军的交换飞行员拉塞尔.戈德曼(Russell Goodman)少校没能活下来，他在坠机时摔死了。
