在战斗中，机组们经常高估了导弹的追踪能力，朝着机动中的目标或飞机，在射程和角度包线之外把导弹打出去。AIM-7和AIM-9都不是为攻击高机动目标而设计的，就像F-4在北越上空遇到的对手那样。AIM-7的初衷是舰队防空，从正面或者侧面拦截向航母编队接近的、于中空或高空笔直飞行的轰炸机。在低空，由于地面杂波的效应，这种武器很容易丢失雷达锁定。
把AIM-7打出去之后，F-4的雷达拦截官要用雷达持续"照射"目标，而飞行员要保持笔直的飞行姿态，不能机动，防止雷达解除锁定导致导弹"飞跑"。起初，导弹在撞击目标后才会爆炸，1959年，AM-7D和之后的型号配备了更实用的近炸引信。在白天，目标的飞行员可能会发现导弹身后的白烟，但看到的那一刻已经为时已晚。
如果麻雀没有在迎头攻击中消灭对手(通常一次齐射2枚)，F-4飞行员将进行180°转向，使用次要武器AIM-9从目标后方补刀。1965年最初的几次遭遇战后，这样的作战情况就从未在北越上空出现过，而且，这样还会让F-4机组处于极度不利的态势。实战中，用液氮冷却的AIM-9D一般都很可靠，但有时被发射出去后会解除锁定，或者直接奔向太阳、云层、地面或"友机"这样的强热源。它的射程确实很远，能够达到11英里，比起1965至66年间的AIM-9B而言，战斗部的重量也增加了一倍。
一枚AIM-7正从一架VF-21中队的F-4J机腹下方加速飞出，这种武器最初用于打击12英里开外巨大的、笔直飞行的目标。导弹的发射要求飞行员和雷达拦截官在开关调节与雷达监视方面的工作协调。雷达系统的完全锁定需要对导弹进行5秒钟的正确编程，使其可以在不同的高度和温度下正常工作。如果目标的机动过载超过3g，导弹通常会解除锁定，以普通的弹道继续飞行。很多早期的发射失败都是由于导弹与机身之间晶圆开关的失灵而导致的，每一次更换开关都要把导弹从飞机上卸下来。麻雀导弹偶尔也被用于打击不同寻常的目标，其中包括清化沿岸试图俘虏美军RVAH-7中队跳伞机组的北越巡逻艇。
AIM-7和AIM-9的发射准备需要机组们进行一系列复杂的开关和雷达操作，他们要低头看座舱里的仪表板，而不是向外盯着目标。同样，在激烈的空战中和敏捷的敌机缠斗，这样的流程显得有些不切实际。雷达拦截官是座舱里的第二双眼睛，当座舱里工作繁忙的时候，这可是十分关键的，但他的工作远不止是操作雷达系统。约翰.卡明斯是F-4后座工作流程的重要探索者：
"和一些人升空，你就是全职系统操作员，操作雷达、电子对抗设备等等。只有少数飞行员需要更多一点的帮助，而你的工作就是在需要的时候提供帮助，在高威胁地区的昼间任务里，我们的注意力更多地集中于座舱外面，寻找高射炮、地空导弹、米格机以及其它目标。"
VF-111中队的前雷达拦截官比尔.弗雷克尔顿(Bill 'Farkle' Freckleton)回忆道：
"舰队防卫拦截和越南的局势没有任何关系，但另一方面，它为系统熟悉和机组协调奠定了基础。使用‘150°至180°转向’的实际系统化程序拦截水平飞行的‘敌机’是不可能的，补充航空大队(RAG，换装训练单位)VF-121里的F-4B和F-4J训练都是针对舰队防空，只有极少数人是空战机动(ACM)的专家(不超过6人)，即便如此，有时一、两个人还想拔腿开溜。"
弗雷克尔顿也评论了F-4B的雷达：
"在越南，我们飞机之间大量使用手语交流，而最常使用的手语就是从左至右的横扫(指代雷达天线的扫描)，紧接着是拇指向上、向下或晃手，指代雷达状态的好、坏或者‘抖动’(状态不好)。"
当一支攻击编队靠近岸边快要走"干脚"时，F-4B雷达拦截官使用雷达的"绘图"模式来查看沿岸的地貌，然后再调至"搜索和跟踪"模式。比尔.弗雷克尔顿解释道：
"离海岸20英里远时，我们集中于空中搜索，用扫描模式操作雷达，在敌机可能出现的方向上保证最大范围的搜索覆盖。我们几乎不用雷达来进行导航或瞄准，但大量使用搜索和跟踪模式。"
1972年，VF-111中队的F-4B 150466(NL204)正在进行传统的俯冲投弹。越战期间，美国海军除了试验以外从未正式使用过激光制导炸弹，战斗轰炸机部队依靠二战时代的方法和简易瞄准装置进行目标瞄准。
由于雷达和导弹无法预测的可靠性，使得美国空军机组倾向于一次性把一种型号的导弹全部打出去(比如AIM-7或AIM-9)，希望能够提高命中率。美国海军的机组看起来更精确，一般一次发射一枚导弹，这样也就提高了潜在的攻击次数。航母弹射起飞重量的限制通常意味着飞机只能在后部挂点挂2枚AIM-7，这样也可以更加有选择性地发射导弹。
奥尔特对导弹改进的要求也得到了回应，诞生了被称为"格斗麻雀"的AIM-7E-2。该型导弹自1968年起开始小批量服役，它的机动性更强，而且由于加装了一个内部电子插头，它的最小射程比AIM-7E更短(1500英尺而不是3000英尺)。这种武器的近炸引信也得到了改进，但很多情况下，导弹刚脱离飞机就爆炸了，跟踪异常或火箭发动机点火故障也经常发生，但它可以在F-4转向时发射。