在冲绳的嘉手纳，18TFW联队于1957年换装F-100。之前在1956年，九州福冈板付基地的8FBG大队就已经完成了换装，两支作战单位在台湾与中国大陆的冲突期间均保持在核战备值班状态下。21TFW联队从1958年到1960年都驻扎在本州的三泽基地，下属的531TFS中队作为一支单一综合作战计划(SIOP)单位就呆在这个寒冷和冰天雪地的基地里，而416TFS中队负责“常规”的战斗轰炸任务。菲律宾的克拉克基地就屯放了武器弹药，让飞行员们保持在战斗状态，该基地本身被作为前往东南亚的一个前进基地。从1959年开始，这里也是405TFW联队510TFS中队的驻地，他们装备的是F-100D。
第一次将F-100部署到泰国的行动被称为“钟声”，作为老挝共产党巴特寮军在3月23日将315AD师一架SC-47B击落的回应，从1961年4月16日起，6架510TFS中队的飞机起飞前往老挝。这些飞机监听了老挝境内的航空无线电通信，7名美军身亡另有一人被俘，这是继二战之后美军首次在这一地区损失飞机。
这些F-100D在曼谷的廊曼(Don Muang)机场执行防空警戒任务，一支80FBS中队的F-100F编队在罗伊.摩尔(Roy Moore)的率领下同样也造访了这里，并且带着泰国的军事领导人上天，“里面有部队的最高司令官，还有国王的妃子，她是泰国的第一位女飞行员。”摩尔接到命令返回克拉克基地，“不要经过空中加油或者转场，直接从北越上空飞过，我不知道这次飞行的目的是不是收集情报，但我知道有一艘情报船躲在海边，在我们飞越的时候记录下所有的雷达活动。”
90TFS中队的F-100D-91-NA 56-3339正在边和基地上滑行，机身的迷彩已经多处掉落。
1962年5月，临时的看见雄鹿(Saw Buck)行动将卡农和英格兰基地的F-100部署到泰国的达欺基地，首先开始的是卡农基地474FBW联队428FBS中队，然后是1962年9月至12月同一联队的430FBS中队。522TFS中队在看见雄鹿III行动中从1962年2月起在达欺驻扎6个月，1964年3月又回来继续驻扎3个月。美军不断加强在东南亚的力量使得401TFW联队将其下属的615TFS中队从1964年8月起部署到南越岘港，之后是612TFS中队。428TFS中队在1964年剩下的时间里被临时部署到岘港，使用522TFS中队的装备和设施。其中一次看见雄鹿行动把路易斯安那州英格兰基地的615TFS中队在1964年6月3日临时部署到克拉克基地，罗恩.比格尼斯(Ron Bigoness)回忆道：
“我们在1964年到菲律宾的轮换驻防起初很平静，但在美国海军的飞机于老挝上空被击落后局势就变得混乱了。我们很快就把飞行员和飞机派往3个地方部署----菲律宾、台南和岘港，我们在菲律宾和台南的飞机负责核打击任务，而且在岘港还完成了一些起落架次。”
1964年6月9日，乔治.拉文(George ‘Raven’ Laven)上校带领着一支编队从克拉克基地起飞前往岘港，这是F-100的第一次作战任务。他鲜亮涂装座机下笨重的450加仑副油箱在接了下来的任务中都造成了不少阻碍。
VFP-63中队RF-8A的扬基队侦察飞行在前一个月就开始了，他们的目的是支援老挝皇家空军的作战行动，而查尔斯.克拉斯曼(Charles Klusman)驾驶一架RF-8A于5月21日被高射炮击中，他在6月6日再次遭到了攻击，液压系统的失效迫使他弹射跳伞。克拉斯曼的这架十字军战士是美国海军在东南亚损失的第一架飞机，为了对此做出回应，8架615TFS中队的F-100D在克拉克基地联队长乔治.拉文(Geroge ‘Raven’ Laven)上校的率领下于6月7日前往岘港，执行超佩刀的第一次作战任务，在越战结束前，F-100总共执行了250000多次作战任务。2天后，这些飞机带着连岘港都没有的2.75英寸火箭发射巢继续部署，但是它们在路上被雨淋坏了。
得到了更多关于任务里相互矛盾的武器使用指示后，615TFS中队的军械员最终给他们的每一架F-100D挂上了火箭发射巢或者4枚500磅炸弹，还有4架KC-135A加油机被派到关岛支援他们，目的就是在第二天将克拉斯曼的RF-8A以及另一架VF-111中队的F-8D击落的高射炮阵地炸掉。目标在石缸平原内，而美军缺少关于那里的地图，同样也在美军的雷达搜索和导航范围之外。其中一名KC-135的领航员帮助两支F-100D编队确定了目标的位置，但是机组们没有照片来核对目标，他们得依靠一座布满高射炮的小堡垒这样的描述来辨别。
第二支F-100D编队和拉文率领的第一支编队跑散了，误炸了距离目标地25英里处的另一座高射炮阵地。拉文的编队对原本的目标造成了一些损失，但由于缺少油料，他们不得不降落在泰国的乌隆基地，此后就得到的特殊的指示，禁止使用泰国领空。拉文的座机在降落时爆掉了一个轮胎(防滑系统被错误激活导致的)，而且在他们最后在夜里返回岘港时又发生了问题，飞机从机场综合布线的临时降落导航灯中间穿过，使得他的僚机杰瑞.迪克森(Jerry Dixon)上尉完全摸黑降落。拉文将这次任务描述为“我一生中飞过最糟糕的任务。”他之后很快就离任了，原因是“那个人轰炸了错误的目标。”
1961年12月，克拉克基地上的F-100D-90-NA 56-3264涂有405TFW联队510TFS中队的涂装，这个独特的紫色垂尾涂装在飞机换成东南亚迷彩后变成了垂尾顶部的中队识别条。飞机的翼下挂载了笨重的450加仑副油箱，而275加仑和335加仑的副油箱都用于内侧挂架(越战期间的标准副油箱)。此机在510TFS中队转移到边和后继续由他们使用，1967年8月22日攻击越共集结地时被击落，飞行员H.D.坎特伯里(Canterbury)上尉跳伞获救。
根据拉文的编队里劳埃德.霍钦(Lloyd Houchin)上尉所描述的，“F-100的第一次任务完全是一场灾难----我们通常将其称为‘团体的摸索。’”尽管参与的飞行员只有几个人具备作战经验，但没有一人在他们并不熟悉的老挝和越南上空暴露出严重的问题。615TFS中队将临时部署期间剩下的时间都放在飞行员们不同的需求上，就像罗恩.比格尼斯解释道的：
“我作为一支四机编队的一员保护一架RF-101C前去执行侦察任务，同样还为一架在北越沿岸进行电子侦听的C-130提供护航，它一路向北飞往海南岛。在这次任务期间我们得进行空中加油，而且我想我们每一架飞机下面都挂有一枚AIM-9响尾蛇。我们同样也执行空战战斗空中巡逻(MiGCAP)任务，保护轰炸北越南方的南越A-1。我们确实在一天要去轰炸北越的福安机场，可是刚开始策划就被取消了。我从未见过一架米格-17，让我们去打下一架吧！每一天都是一次惊喜，因为我们不知道接下来会从西贡发来什么样的命令。”
510TFS中队在之前驻扎于廊曼机场期间没有参与什么战斗，而这支中队于1964年6月从达欺转移至南越的新山一机场，在那里为参与扬基队行动的RF-101C侦察机护航。他们在6月中再次起身前往岘港，之后还是继续执行护航任务，但也被2AD师的师长约瑟夫.摩尔(Josepf Moore)少将安排在新山一警戒。这意味着2架飞机处在15分钟起飞状态，而另有4架处在1小时起飞状态，以应对任何可能需要的美军侦察机护航任务。同样的一个警戒设施于1964年中在达欺基地建成，为联合空中打击部队的救援部队提供保护。
F-100D-56-NA 55-2914是为数不多的几架在起飞时就被小口径武器击中的超佩刀，时间是1968年6月18日，G.J.布尔特少校在爬升过程中跳伞，距离潘朗基地仅10英里。
就是在这样的一次任务里，F-100在东南亚服役了2年多后第一次被击落。8月18日，巴特寮打掉了一架老挝皇家空军的T-28D，然后用高射炮陷阱击落了前来救援的一架美国航空(中央情报局)的UH-34直升机。一支474FBW联队的F-100D编队被召从达欺起飞，前往石缸平原的坠机点，他们在那里用20mm航炮扫射了巴特寮的高炮阵地。阿尼.克拉克(Arnie Clark)中尉驾驶的F-100D 56-3085被击中，液压系统失效，他成功驾驶飞机飞越泰国边境，在廊开(Nong Kai)附近跳伞并被另一架中情局的直升机救走。克拉克后来成为了一名“神秘”前进空中管制员，1969年1月22日驾驶F-100F 56-3886在茱莱附近被击中跳伞。他于1972年第三次来到越南，驾驶一架A-7D“桑迪”(救援战斗空中巡逻机)执行了长达9小时的救援任务，因此被授予空军十字勋章。
从1964年10月14日开始，保护老挝皇家空军的T-28就成为了F-100的日常任务。一次史诗般的救援----在越南早期的救援行动之一----去营救威廉.马丁(William Martin)上尉，这是被巴特寮防空炮火击落的第二架F-100D。1964年9月，613TFS中队取代了410TFS中队继续驻扎在岘港执行扬基站任务，通常派出的是F-100D双机编队。11月18日，马丁在与巴特寮高射炮的决斗中失利，他的飞机坠毁于北越边境附近。一支由8架F-100、13架F-105D、6架海军A-1和一架美国航空C-123、4架直升机以及1架UH-16空中管制机组成的大机群展开了为期2天的救援行动。然而，当其中一架直升机的副驾驶降到坠机点时发现马丁在着陆时撞到石头上摔死了。
1969年完成了最后一次飞行任务后，308TFS中队的飞行员杰夫.麦卡锡(Geoff McCarthy)被水喷。F-100D-21-NA 55-3511在加州萨克拉门托空军材料中心(隶属空军后勤司令部)做飞行测试时刷有红白相间的涂装。服役于308TFS中队后，此机在1969年12月28日从绥和起飞后不久便被小口径武器击中，飞行员C.W.梅耶斯中校在距离基地20英里处跳伞。
1964年11月和12月初，作为越共攻击美军基地后发起的还击，F-100轰炸了老挝北边的敌军补给线。寻路者RF-101C通常被用来率领F-100D前往目标，之后将拍摄照片带回去评估轰炸效果。F-100第一次轰炸北越时使用的就是这种战术。
早期的部署让许多F-100中队获得了最基本的作战经验，其中很多中队后来又再次回到战区里。他们将展示出这种飞机是有效的对地攻击武器，同样也揭示了任务中无时不在的高射炮威胁和地形的复杂。