1996年还损失了2架苏-25，第1架于4月4日在托伊斯科耶(Toiskoe)村附近被ZU-23-2高射炮击落。368ShAP团的飞行员亚历山大.马特维恩科(Alexander Matvienko)大尉成功跳伞，但是落地后和试图抓获他的车臣武装分子爆发了枪战。他在最后一刻被一支搜救队接走。第二架损失的是苏-25UB，时间是5月5日，还是来自于368ShAP团，在一次预定目标的轰炸行动中于乌鲁斯马坦(Urus-Martan)附近被肩扛式地空导弹击落，机组伊戈尔.斯维里多夫(Igor Sviridov)上校和奥列格.伊萨耶夫(Oleg Isaev)少校均阵亡。
苏-25部队在两次车臣战争中的部署。
起初，亚历山大.科什金只是461ShAP团1AE的中队长，接下来被晋升为副团长，他在第一次车臣战争期间完成了不少于200个战斗起落架次。1995年末，他被派去摧毁一门D-30 122mm榴弹炮，他最后于格罗兹尼以北9英里处一座废弃的农场里发现了这门火炮，距离阿尔贡(Argun)不远。经过了20分钟的搜索，他在距离搜索起始点数千米开外的雪地里发现了牵引火炮的卡车(空袭过后派出的一支侦察队确认了这个战果)，然后他攻击了这座农场：
"我让我的僚机从北方去攻击那座T形建筑(农舍)，同时，我从西面进来扫射。命中后，目标冒起了黑烟，这样的情形经常在柴油或发动机油料被点着后出现。"
干掉了藏在农场里的这门火炮后，科什金被匆忙派往古杰尔梅斯(Gudermes)，去搜索一辆刚攻击过俄军的BM-21冰雹多管自行火箭炮。2架苏-25很快就抵达了火车站旁边的目标区，科什金命令他的僚机于14750英尺高度上盘旋，自己降到80英尺高度上，继续去搜索这辆自行火箭炮。在目标区上空的第3次转向中，他发现了类似一辆BM-21火箭炮卡车车头的物体，停在一个拱形的掩体内。科什金决定第四次转向，再度观察那座掩体，迎面向它飞去，以便看个清楚。接下来，他做出了一个攻击机动，然后在平缓的俯冲中用航炮扫射了这个目标。这时，他的一台发动机被大口径重机枪击中，而且起火了，科什金迅速做出反应，启动了灭火装置：
368ShAP团的苏-25BM在莫兹多克机场的停机坪上，旁边摆放着FAB-250-270高爆炸弹。
"我开始转向捷列克(Terek)河，准备在大火没法扑灭的情况下跳伞。幸运的是，灭火系统工作良好，我的苏-25继续借助1台发动机飞行，把速度保持在280英里/小时。然而，我没法爬升，而且在1300英尺高度上一架缓慢飞行的苏-25对于敌人来说是一个绝好的靶子。最后，我还是开着这架飞机飞到捷列克河上空，离开了敌人的领空。我松了一口气，报告了那门最初在攻击C2中心时发现的冰雹火箭炮车的具体位置。降落后，地勤们发现我的苏-25被一发14.5mm子弹击中，打穿了发动机供油系统的翼根油管，漏出的油料洒在炽热的发动机尾喷管上，引发了大火。"
在车臣的反叛乱战术
两次车臣战争期间，预定目标的空袭行动由2支或3支苏-25双机编队执行，在30分钟的时间内完成攻击，而其它的双机编队则在莫兹多克的机场上等待，准备于任何时候去支援攻击编队，或者是为正在交火中的地面部队提供随叫随到的近距离空中支援。一架混挂炸弹和火箭弹的备用机也停在机场上，准备随时应召起飞去紧急支援。
一名飞行员基本上每天要飞2个起落架次，但是在战斗激烈的时候，地面部队不停地请求近距离空中支援，这时，"蛙足"飞行员每天最多要飞5个架次。
一架461ShAP团的苏-25准备从莫兹多克起飞，前去执行任务，这架飞机挂载了副油箱、B-8M1火箭巢赫R-60空对空导弹。
接近目标区的时候，苏-25双机编队通常在12500至16730英尺高度上巡航，然后转向，以45°至60°角俯冲投弹或发射火箭弹，以求达到更好的攻击精度。ASP-17BTs-8光电瞄准具仅能用于人工瞄准，没有任何自动校正的手段，而且由于在山区间环境导致枫树-PS激光目标指示/测距仪出现明显的测距误差，也无法使用。
通常，长机飞行员首先转向，僚机留在安全高度上，在头顶上盘旋，并搜索地面上任何高射炮开火的亮光及地空导弹发射的痕迹。当威胁出现后，僚机就要及时警告长机，然后立刻转去攻击重机枪/高射炮或者地空导弹阵地。在第二轮攻击中，2架飞机互换角色，僚机攻击目标，而长机到上方掩护。在使用火箭弹或炸弹攻击时的最小拉起高度是1970英尺，使用航炮扫射时的最小拉起高度为660英尺。
第二次车臣战争
第二次车臣战争于1999年8月至2002年4月间展开，当时的军事作战阶段是作为反恐行动而结束的，这次战争给毛病多多的俄罗斯战争机器带来了诸多挑战。俄罗斯空军再度在地面部队占领关键城市的战斗中起到了重要作用，他们继续围剿躲在山区里顽抗的车臣武装分子。
苏-25机群发动的一次最大规模的空袭是在1999年9月27日，就在俄联邦军队进入车臣前4天。参与的有1ShAD师旗下所有3支强击机团的苏-25，这些飞机全部都被集中部署在莫兹多克。60架飞机一波流全部起飞，保持无线电静默，攻击大量车臣境内的预定目标，主要是汗卡拉(Khankala)、加里诺夫斯卡亚(Kalinovskaya)、格罗兹尼北机场，同和还有已知囤放有重型军事装备的设施。行动期间使用的主要武器是带穿甲弹头的火箭弹以及高爆炸弹。
这架升级后的苏-25SM隶属于布琼诺夫斯克的368ShAP团，该团的初战就是南奥塞梯战争。SM型的升级方面包括了更加复杂的PrNK-25SM综合数字化导航/攻击设备，通过卫星的校正，武器的导航精度可以达到46英尺偏差，而没有校正的偏差则达到了660英尺。加上新的抬头显示器、武器计算机、导航/攻击系统的数字化元件保证了飞机相比起标准型的苏-25在使用非制导武器时的精度更高(高出了2至3倍)。
第二次车臣战争期间的首例战损出现在9月9日，一架来自960ShAP团的"蛙足"在用火箭弹攻击达吉斯坦境内卡拉马希(Karamakhi)地区的目标时两台发动机失效。飞行员谢尔盖.马克西莫夫(Sergei Maximov)少校决定不重启发动机，而尽可能远地滑翔来。接下来，他跳伞了，并且被一支搜救队接走。10月3日，一架来自368ShAP团的苏-25在托尔斯泰蒙古包(Tolstoi-Yurt)村附近被高射炮击落，飞行员安德烈.赫梅列夫斯基(Andrey Khmelevsky)大尉阵亡。
第二次车臣战争期间最大规模的一次搜救行动于12月13日发起，当时368ShAP团的团长谢尔盖.鲍里斯尤克(Sergei Borisuk)上校被击落。根据一些材料指出，他的苏-25BM在攻击阿尔贡峡谷巴奇蒙古包(Bachi-Yurt)地区的目标时被肩扛式地空导弹击落，而其它材料说这架飞机挂载的一枚122mm火箭弹爆炸后点燃了主翼下的B-13L火箭发射巢内的5发火箭弹，导致飞机坠毁。
跳伞落地后，鲍里斯尤克和地面上的车臣武装分子爆发了枪战，后者发动一场大规模搜索行动，试图俘虏他，最后，他被一架俄罗斯空军试飞中心的米-8MT直升机救走。但是在这为期3天的救援行动期间，俄军动用了苏-25、米-24、米-8MT，而且遭受了惨重的损失，一架米-8MT和一架米-24被击落，6名军人阵亡，还有6人受伤，另有3架直升机被小口径武器和重机枪打成重伤。
第一次试图救援鲍里斯尤克上校的行动于12月13日展开，损失了一架米-8MT和一架米-24后以失败告终。最后，在12月15日，搜救队第3次尝试去把他救走，而这次终于成功了。