高空轰炸任务
随着射程更远(达到21450英尺高度)、抗干扰性更强的毒刺地空导弹的出现，在山上使用这种武器的射高达到了29700英尺，迫使飞行员要到山区上方获得足够的高度去投弹，然后再爬升脱离，才不用担心被地空导弹击中。
随着毒刺导弹在1986年末/1987年初的大量使用，苏-25飞行员们被要求在高空轰炸，最低拉起高度被限制为14760英尺，投弹高度在24600至21320英尺范围内。
在毒刺导弹出现的高威胁区内，主要的攻击机群由1至2支苏-25四机编队组成。每架飞机以15秒钟的时间间隔轮流俯冲攻击，每架飞机之间的航向夹角为15°至20°。高空的俯冲角在45°至50°之间，投弹高度在山地上方14800至16500英尺处。最低高度被限制在11500英尺，从投弹开始至爬升回地面上方19800英尺高度期间不停地发射红外干扰弹。通过这样的方法，地空导弹的威胁被明显消除了，但获得安全的代价是攻击效果被显著降低了，因为在高空投弹和发射火箭的精度更差。
而且当苏-25飞行员受命进行70°角俯冲的时候，起始高度被提升到了29700英尺，投弹高度在21300至23000英尺之间，俯冲后拉起的最低航迹高度被限制为14760英尺以上。在笔直的俯冲过程中，苏-25很容易超速，而且通常会突破设计中要求的620英里/小时限制。
在他的作战经历记录中，亚历山大.阿拉斯拉诺夫少校回忆道战区内的苏-25面对着大量增长的毒刺导弹威胁而做出的反应：
苏-25挂架上填满S-13大口径火箭弹的B-13L火箭巢。
"1987年12月，我们开始面对不断增长的威胁，但是那时候任务的复杂性和责任也显著增长了。因为敌人开始在山上用毒刺导弹设伏，把射高增加至21300英尺，所以这就是我们为什么被命令在目标上空26200英尺高度处巡航的原因。
"此外，除了在这样的高度上很难发现目标以外，我们还面对着另一个严重的问题，我们的飞机是为了战场上生存下来而量身定做的，能够有效地防御破片和飞溅物体，其中包括了大口径机枪，但非常不适于在高空执行任务。当然，这种飞机在这样的高度上飞行一点问题都没有，但是未增压的座舱迫使我们时刻都要带着氧气面罩，时刻呼吸着纯氧。起初，我们的身体看起来不会受到这种高空作战的影响，但是，降落后在地面上呼吸时相当的难受，这样的疼痛来自于胸腔后面的脊椎。我们的医生拒绝为我们治疗这样的小毛病，而当我们寻求解释时，他们说这是氧气诱导的肺部烧伤。事实上，这样的疼痛是由于笔直的俯冲中急速增压而导致的。在如此的迅速改变的气压环境下，引起了肺胸膜的部分分离。
"我们还面临着一个更大的、飞行中的危险----飞机上的氧气设备失效后，供氧就中断了。幸运的是，这样的事情极少发生。此外，飞行员有时候忘了把氧气面罩和供氧设备连接上，结果导致在高空上缺氧。我们团里至少有2名飞行员因为这种情况而坠机身亡，两人都在进行夜间飞行时不省人事，因此，当飞行员没法拉动操纵杆时，飞机就会出现滚转和失去高度的倾向。"
掩护苏军撤退
1988年4月7日，国防部长德米特里.亚佐夫(Dmitry Yazov)元帅批准了将10万6千名苏军撤出阿富汗的计划，整个计划共分2个阶段，第一阶段在1988年5月15日至8月15日间，第二阶段在1988年9月1日至1989年2月14日间。
1988年11月的巴格拉姆机场内，一架第1中队的苏-25正在滑入停机坪。
378OShAP团在撤退计划中被给予了重要地位，而且是最后从阿富汗撤出的苏军部队之一。该团被要求不间断地打击苏军撤退路线途中敌人的任何阵地和据点，而且在部队夜间行进的时候投放照明炸弹，防止可能遭到的伏击，阻止敌人借助着夜色的掩护来攻击并发射炮弹。
在撤退计划中，378OShAP团把8架飞机部署到喀布尔机场，防止这里的设施遭受攻击，同时为从加德兹、阿萨达巴德、贾拉拉巴德撤出的苏军提供空中支援。该分遣队在1988年5月3日抵达，而且立刻就开始执行任务，到潜在的火箭发射地点上空持续巡逻来阻止敌人朝机场上发射火箭弹。发现了火箭弹发射的烟迹和地点后，苏-25将会立刻冲下去攻击。
苏联空军的"蛙足"机群在阿富汗战争期间遭受的最惨重的一例损失就是在6月24日夜，当时，喀布尔机场上的10架苏-25里有9架被炸毁。一发火箭弹直接命中了一架加满油料、挂满炸弹的苏-25，然后大火很快就吞噬了旁边紧密停在一起的8架飞机。只有一架苏-25因为及时被地勤们滑出来而幸免遭灾。4天前，在6月20日，还有一架"蛙足"于坎大哈机场上被火箭弹炸毁。
1988年6月24日喀布尔机场上的大火把停成一排的9架-苏-25烧毁了，其中每一架飞机都挂满了弹药、加满了油料，准备随时起飞执行任务。这场火灾是由一枚火箭弹直接命中一架“蛙足”而引发的。
1988年7月初，378OShAP团接收了5架第10批次的机体，这些飞机之前由372OIShAE(Отдел'ная Инструкторская Штурмовая Авиационная Эскадрилья：独立教导强击中队)中队使用，驻扎于乌兹别克斯坦吉扎克(Djizak)的1038作战训练和机组换装中心。这些飞机作为在6月24日那次损失后的补充机体被派驻到喀布尔。
3AE中队于1988年7月初离开坎大哈，起初被部署到信丹德2周，然后转移到巴格拉姆永久驻扎。这些苏-25从这里继续为坎大哈提供掩护，保护运输机和直升机在起降时免遭地空导弹攻击，同时攻击机场周围的敌军迫击炮和火箭弹发射阵地。8月7日，6架3AE中队的苏-25被部署到昆都士(Kunduz)机场，剩下的转移到巴格拉姆，然后继续驻扎至10月，接着再度回到信丹德。
在他的记录中，1AE中队的飞行员亚历山大.阿拉斯拉诺夫少校回忆道1988年10月在阿富汗的大体局势，此时，苏军已经开始全面撤退：
正在降落中的苏-25UB“火花”双座机，飞机后座舱的两侧均加装了装甲。
"这个国家里的局势已经变得一片混乱！政府军在阿萨达巴德和贾拉拉巴德被敌对武装完全截断了，而且准备投降。当地部队无法守住并保护所有的这些被我们放弃的据点和城市。我们的撤退过程有3个备选方案，第一个就是正在进行中的，第二个就是所有部队全部通过萨朗小道，如果这条小道被切断了，那么第三个方案就是把所有装备扔下，通过空运来撤离----这是我们最后的选择。"
在378OShAP团的从1987年10月28日至1988年11月17日的第4次轮战期间，他们完成了11779个战斗起落架次，共计8809个飞行小时，其中138个架次是专门的近距离空中支援(占总任务的1.2%)、7276个是预定空袭(占总任务的62%)、1522个是自由狩猎和巡逻(占总任务的13%)、1410个是航空布雷(占总任务的12%)。一共消耗了2756发火箭弹和42157枚炸弹，加上12691枚其它炸弹(主要是照明炸弹和烟雾炸弹)。