联合力量行动中，AGM-130的录像画面显示出导弹在击中目标的时候，载机还在50英里开外。然而，这个距离并不准确，无法反映出导弹真正的射程，因为飞机发射完导弹后会做180°转向。除此以外，它清楚地给出武器和数据链吊舱的能力，这其中包括一个后视的机械扫描的相控阵天线，使得炸弹朝相反方向飞行时能够继续被操控。
正是一枚AGM-130在一列客运火车从一座大桥上通过的时候炸中了这座大桥，结果使得很多平民丧生。这次事件在世界范围内的媒体上遭到了大量的谴责，但是里斯中校于2005年1月接受采访时解释道，每一次北约和F-15E机组使用精确制导武器时都会避免这样的事情发生：
"从作战层面上看，我们一直努力在尽力减少给外部带来是损失，我们尽一切努力来降低对无关的平民所造成的伤害，即便会将我们置于危险中，我们也会特意改变攻击特定目标的时间，来避免伤及平民。我们会遵从日内瓦公约的武装冲突条款来降低对外界造成的伤害。我知道飞这次任务的机组，而且我可以告诉你那名武器系统官一直到今天都还在为那件事情而内疚。在这一例中，他们当时所能获得的信息都指出轰炸的那座桥是安全的。"
不管是白天还是夜晚，好天气还是坏天气，F-15E被证明是巴尔干战区里是最有力和最可靠的战机。当一些飞机由于天气原因而不得不停在地面上时，只有攻击鹰在继续执行任务，但这样到敌人领土上空飞行时危险性也增大了。
这次事件之后，北约对目标轰炸的授权级别被提升到必须经由19个成员国全部同意才能被加入空中任务指令里。相对更少的目标被允许攻击，但是也有令人沮丧的任务没有出现在新闻里，因为北约没有放出细节，或者是不具备新闻价值，里斯解释道：
"塞尔维亚人很聪明，适应能力很强，而且知道对周围造成的附带损伤就是我们'阿基里斯的脚后跟'。因此，我们得靠近目标，寻找一切在意料之外中出现的事物。我的一个朋友在操控一枚AGM-130飞行时发现目标不在原定的位置上，而此时面对的是一座教堂。他匆忙把导弹拉起来，然后落入教堂后面的空地上。这对他来说是非常令人沮丧的，然而，轰炸这样的目标违返了交战准则，因此他把导弹拉起来是对的。"
1996年6月，米洛舍维奇让步了，允许上万名科索沃-阿尔巴尼亚人返回他们的家乡。联合守卫行动很快就被发起，来保证整个返乡期间的全面安全，492FS中队的6架飞机于2000年1月10日前往阿维亚诺驻扎了3个月，接下来在同一年由494FS中队的分遣队替换。
第五章 阿富汗反政府武装
2001年的9.11恐怖袭击事件发生后31天，391FS中队的12架F-15E离开爱达荷州前往科威特的艾哈迈德.贾贝尔基地，途中经留西班牙，抵达中东后加入332AEG航空远征大队。在他们从贾贝尔基地起飞前24小时本要去参与伊拉克上空的南部守望行动，但此时却变成了阿富汗上空的持久自由行动。
从某些方面来看，391FS中队的18支机组已经为接下来的战斗做好了充分的准备，美国和阿富汗之间的关系在比尔.克林顿总统于1998年10月下令用巡航导弹轰炸奥萨马.本.拉登后就一直很脆弱。这一次让人回想起4TFW联队于90年代中的一次演习的部署期间，精明的策划者和中队里的"臂章穿戴者"依靠自己的力量来绘制一幅阿富汗的地图，并将其提供给F-15E机组。
在中队的保险库外工作，策划者们凑齐了一幅基本的地图，里面标注有不存在的空中威胁和一个很简单的防空系统，包括了人工操作的防空系统和高射炮。抵达科威特后去执行一项不确定的任务，他们至少知道接下来将会去做些什么。
2001年10月12日，12架366AEW联队391FS中队的F-15E离开爱达荷州的芒廷霍姆基地参与持久自由行动。88-1667号机便是其中之一，此机之前属于4FW联队，大修后转交给391FS中队，2002年10月转交给90FS中队并服役至今。
值得肯定的是，在391FS中队研究阿富汗残破的设施前，只有极少的固定目标真正具有价值。确实，中队经过了特殊的训练，而最后将和前进空中管制员进行大量的协作，就像391FS的中队长安德鲁.布里奇吉(Andrew Britschgi)中校反映道的：
"我们知道，如果受命去轰炸阿富汗的目标，就一定要和前进空中管制员合作----因此，我们于和平时期专门针对这种战斗任务进行训练。我们同样知道在任何部署行动中，自己都将是承担打击任务的主要力量，而且毫无疑问，我们所受训的成果也会很好地体现在阿富汗战场上。"
391FS中队的机组们认为前进空中管制员将通过抗干扰无线电引导他们飞向机动目标或者时敏目标(TST)，时间将很快会告诉他们预测是如何的准确。
佛罗里达州麦克迪尔空军基地的联合空中作战中心(CAOC)编写了空中任务指令，2001年10月末，'TJ'率领391FS中队的第一波F-15E攻击任务，在目标上空只遭遇了轻微的抵抗。下午回来的时候，第二批攻击鹰从贾贝尔基地起飞了，接下来就是为期3个月轮流不停的轰炸。
持久自由行动中，特种部队的前进空中管制员和空军/陆军的应征战术空中管制员是F-15E在行动力取得成功的关键因素。
"在前两个星期里，军事建筑、塔利班的补给点、山洞和基地组织的训练营是我们轰炸的重点"，'Fang'说道，他是一名经验丰富的武器系统官，之前参加过巴尔干的战斗和伊拉克上空的南部/北部守望行动。
"机组们在起飞执行任务的前一天晚上拿到'碎片'(空中任务指令)，那些不参与飞行的人将从空中任务指令里跳出来，于晚上剩下的时间里策划第二天的任务，而得到任务的机组则登机起飞。我们自己的支援是不足的，我们使用一些商业资源，比如从乔治亚州立大学要来分辨率为5米的卫星照片，以填补空白。联合空中作战中心则为我们提供武器型号和投放模式的建议，整个中队都将以我们眼中最佳状态的运作起来，但是联合空中作战中心真的很少告诉我们应该怎样把事情做完。任务被策划好之后，接下来执行任务的机组将在做简报前一小时抵达，让他们自己熟悉飞行路线，报告任务，然后走进飞机启动发动机。"
前几周都使用了AGM-130和电视GBU-15两种2000磅级别的炸弹，来打击山洞里的设施。他们同样还习惯了在普通条件下轰炸难以识别的目标，或者需要特定武器进行攻击。
这是电视GBU-15首次被用于实战，而这也只是391FS中队在阿富汗创造的诸多"第一"之一。使用BLU-109穿透性弹体的GBU-24A/B同样也被用于摧毁塔利班的加固目标和地下设施。Mk84弹体的GBU-24A也被投放下去，两种亚型号都安装了WGU-12B/B或者WGU-39B激光引导头，使得GBU-24可以从低空投放，GBU-28被用于轰炸塔利班的指挥和管制中心以及山洞的入口----总共扔下了5枚。
2001年10月13日的贾贝尔机场上，地勤们站在跑道边，目送着391FS中队的飞机升空，执行首次持久自由行动中的空中打击任务。此机挂载了9枚GBU-12、2枚AIM-9M和2枚AIM-120C，此外还有2个610加仑的副油箱，这成为了持久自由行动中轰炸任务的标准挂载方式。
通常情况下，一支F-15E双机编队和一支F-16双机编队混编执行任务，'Spear'回忆道：
"F-16有甚高频无线电(F-15E上没有安装)，这样使得和民用航空管制台之间的交流更加方便，因为其大多数都不使用超高频无线电。所有的参与者都对预警机和地面前进空中管制员能够用超高频无线电交流而感到欣慰，因此在前往和回来的路上，甚高频无线电把一切都变得更加简单。大多数时间里，我们都使用双机编队，然后和阿富汗上空的F-16取得联系，他们的飞行路线一般都和我们的不一样，但使用同一架加油机，使用F-15E四机编队真的相当的少。"